网易企业邮箱成立以来，有过多次变革。其中有以下：
2009年3月，网易CEO丁磊在北京产品发布会上宣布正式进军企业邮箱市场，标志着网易邮箱不但是中国第一大电子邮件运营商，更是国内提供最全面邮件服务的运营商。网易企业邮箱，采用业内顶尖技术，由具有丰富经验的专业团队开发运营，致力于为企业用户提供中国最专业的电子邮箱服务。
2011年9月，网易邮箱面向企业用户，推出"网易即时通"即时通信工具，和网易企业邮箱一起为企业打造云服务平台。
2011年10月，
网易企业邮箱获得中国信息安全测评中心授予的EAL2级信息安全等级认证，这是目前国内最高级别的邮件系统安全认证，网易成为互联网业界唯一获此认证的公司。
2012年1月，网易企业邮箱事业部正式推出网易企业服务，打造企业级产品矩阵，提供一体化企业信息化沟通解决方案。2012年，网易企业邮箱已稳居国内企业邮箱市场前三甲。网易企业邮箱正在深化平台化建设，在企业邮箱功能方面持续推陈出新，且在企业网盘、企业即时通等多项增值产品上持续加大投入，不断完善企业服务平台，网易未来将继续向企业服务领域深入，为企业提供更加多样化的服务;并且，提高用户质量和用户忠诚度，通过提高准入门槛，为优质企业提供服务，以便提高整个有效企业用户群体的质量。
2012年第二季度，企业邮箱企业客户户数量已经超过14万家，其中付费企业客户数量达到4.8万多家。
2012年8月个人网易邮箱5.0版是网易邮箱团队历经十个月研发、精雕细琢、潜心打造的重量级产品，不仅全面基于HTML5标准，而且整体性能优化提升35%以上。企业邮箱已全新升级为5.0版本，更为简约。
2013年又增加了发送和接收会议后在日程管理添加日程的功能，邮件数据存储目录的迁移功能，自定义标签功能.标签邮件夹，方便统一查看所有标签邮件，退出时自动清空已删除的设置项，优化了新邮件提醒窗口，可快速标记和删除新邮件，优化了全屏、断网等情况下的提醒窗口表现，超大附件功能，上传过程中可进行其他邮件操作，搜索发件人姓名时与通讯录匹配的功能，添加发件人到黑名单并删除相关邮件的性能.根据输入的手机号码自动补全邮箱后缀功能，附件的右键菜单，并支持ctrl+c复制，创建帐号时的服务器配置，专有协议帐号删信同步到网页邮箱的策略，收取代发邮件时的发件人显示方式，群发邮件时把自己添加到收件人时回复全部的表现，修复了发信后已发邮件显示两封的问题，在菜单栏和预览区回复邮件不一致的问题，锁定邮箱时仍会显示便签内容的问题，网易邮箱5.0通讯录部分内容无法同步问题。
经过多年来的努力，
网易企业邮箱已经成为世界领先水平。也是中文邮箱第一品牌。